Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MitfQ08874 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MitfQ08874 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MitfQ08874 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MitfQ08874 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MitfQ08874 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms