Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdf9Q07105 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gdf9Q07105 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms