Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VldlrP98156 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VldlrP98156 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VldlrP98156 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VldlrP98156 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VldlrP98156 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms