Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rom1P32958 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rom1P32958 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rom1P32958 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rom1P32958 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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