Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lamc1P02468 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lamc1P02468 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lamc1P02468 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms