Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dll3O88516 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dll3O88516 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dll3O88516 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dll3O88516 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dll3O88516 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dll3O88516 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dll3O88516 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dll3O88516 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dll3O88516 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dll3O88516 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms