Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f6O54917 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f6O54917 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f6O54917 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2f6O54917 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f6O54917 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2f6O54917 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2f6O54917 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
E2f6O54917 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2f6O54917 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms