Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dkk1O54908 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms