Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r194J3JS27 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r194J3JS27 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r194J3JS27 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms