Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms