Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrlQ9JJU8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms