Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Irx6Q9ER75 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms