Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ7

Aurkaip1, Aurora kinase A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aurkaip1Q9DCJ7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.1 ms