Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ7

Aurkaip1, Aurora kinase A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aurkaip1Q9DCJ7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Aurkaip1Q9DCJ7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aurkaip1Q9DCJ7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms