Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Spns3Q9D232 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Spns3Q9D232 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms