Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tsnaxip1Q99P25 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tsnaxip1Q99P25 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms