Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl27Q99N92 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl27Q99N92 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl27Q99N92 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl27Q99N92 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl27Q99N92 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl27Q99N92 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl27Q99N92 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl27Q99N92 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl27Q99N92 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl27Q99N92 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl27Q99N92 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms