Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gps1Q99LD4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.7
Gps1Q99LD4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gps1Q99LD4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gps1Q99LD4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gps1Q99LD4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gps1Q99LD4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gps1Q99LD4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gps1Q99LD4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gps1Q99LD4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gps1Q99LD4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gps1Q99LD4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gps1Q99LD4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gps1Q99LD4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms