Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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Ubqln3Q8C5U9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Ubqln3Q8C5U9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Ubqln3Q8C5U9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Ubqln3Q8C5U9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubqln3Q8C5U9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Ubqln3Q8C5U9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Ubqln3Q8C5U9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Ubqln3Q8C5U9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Ubqln3Q8C5U9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Ubqln3Q8C5U9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ubqln3Q8C5U9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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