Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc30Q8BVF4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc30Q8BVF4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms