Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcl3Q8BVF2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl3Q8BVF2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms