Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trappc6aQ78XR0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trappc6aQ78XR0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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