Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4930567H17RikQ3V0K5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930567H17RikQ3V0K5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms