Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb3P09026 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb3P09026 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms