Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmb10O35955 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms