Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac1O09106 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac1O09106 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac1O09106 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms