Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna3O08545 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna3O08545 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna3O08545 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna3O08545 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna3O08545 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna3O08545 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Efna3O08545 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efna3O08545 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Efna3O08545 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms