Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r194J3JS27 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r194J3JS27 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms