Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4aF8VPX6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4aF8VPX6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4aF8VPX6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms