Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8247F6VRJ8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8247F6VRJ8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms