Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

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Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Herc1E9PZP8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Herc1E9PZP8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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