Protein–RNA interactions for Protein: E9PV26

Prr36, Proline-rich 36, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr36E9PV26 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prr36E9PV26 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr36E9PV26 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms