Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm4491E0CX42 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm4491E0CX42 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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