Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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