Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubl3Q9Z2M6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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