Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sh3bgrlQ9JJU8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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