Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx6Q9ER75 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx6Q9ER75 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms