Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D5Q8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Q9D5Q8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D5Q8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D5Q8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D5Q8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D5Q8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D5Q8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D5Q8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D5Q8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D5Q8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms