Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtpbp4Q99ME9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gtpbp4Q99ME9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms