Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrif1Q8CDD9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrif1Q8CDD9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.7 ms