Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc30Q8BVF4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms