Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc125Q5U465 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc125Q5U465 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc125Q5U465 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms