Protein–RNA interactions for Protein: Q1LZI2

Slc35f3, Putative thiamine transporter SLC35F3, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35f3Q1LZI2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc35f3Q1LZI2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc35f3Q1LZI2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.5 ms