Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bop1P97452 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bop1P97452 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bop1P97452 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Bop1P97452 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bop1P97452 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bop1P97452 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bop1P97452 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bop1P97452 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms