Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fgd1P52734 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms