Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5cP41230 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5cP41230 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5cP41230 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5cP41230 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5cP41230 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Kdm5cP41230 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm5cP41230 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm5cP41230 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm5cP41230 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm5cP41230 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm5cP41230 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kdm5cP41230 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.8 ms