Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tacr1P30548 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tacr1P30548 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms