Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp1P29452 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp1P29452 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp1P29452 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp1P29452 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp1P29452 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Casp1P29452 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp1P29452 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp1P29452 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casp1P29452 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Casp1P29452 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms