Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chil3O35744 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chil3O35744 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chil3O35744 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chil3O35744 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chil3O35744 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chil3O35744 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chil3O35744 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms