Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Catsperg2C6KI89 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Catsperg2C6KI89 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms