Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Brpf1B2RRD7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brpf1B2RRD7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms